漫画《红壳潘多拉》的动画，最初由《攻壳机动队》的士郎政宗和《Excel Saga》的陆道真司起草。这是一个机器人和自主机器人在一些发达国家开始普及的时代。娜娜科罗宾妮（Nanakorobinene）是一名女孩，由于幼时的一次事故，除了大脑以外的整个身体都变成了假体，她在亲戚的帮助下来到了人工度假岛“Senancle Island”。然而等待他们的却是充满全副武装的恐怖分子和大规模杀伤性武器的新生活...